日本人一般在大自然中做的运动通常是健行或登山。特别是在年长者当中，有许多人把登山当作兴趣。位于高知县的四万十川因其河流清澈而闻名，于是诸如独木舟之类的运动也便在当地非常兴盛。大自然中的各种竞赛也非常受到欢迎，以长野县八岳为首，各地区山中常会举办自行车的登山赛及山间慢跑，甚至距离超过100公里的远程马拉松比赛。

日本具有横穿位于本州的日本阿尔卑斯山等高山的文化，主要的山区都有山中小屋可住宿。东京都近郊则有获得米其林指南三颗星的高尾山（如图）是著名的登山景点。高为啥呢也有缆车可乘坐，因此即使是初学者也能轻松登顶。以富士山为首的险峰，如果搞错登山时期就有可能会有生命危险。务必要穿着适当的外套及鞋子等装备，并充分制定好登山计划。

日本各地有各式各样的河川，主要在气温较高的夏季，可享受独木舟与皮艇等竞赛型运动、或是可乘坐橡皮艇顺着河川而下欣赏沿途风景。东京都奥多摩、埼玉县长瀞、群马县水上、栃木县鬼怒川等地皆是可享受河川活动之乐的人气地区。

在日本，也有参与热气球与滑翔翼等空中运动的机会。在东京都近郊的栃木县渡良瀬和长野县的白马都体验此种活动。特殊的运动还有洞窟及钟乳洞中探险等洞窟体验活动，可在奥多摩等处体验。此外，山梨县八岳等地的牧场则有骑马体验活动。不同地区都有着其独有的自然休闲运动。

夏季时须随身携带除虫药，服装则避免选择肌肤露出程度多的服饰。此外，为预防中暑，建议戴帽子。于日本登山时，基本不得在除了被称为露营区之外的地区露营。细致的规矩还包括上厕所必须使用山中小屋的收费厕所，所以请学习并适应其他登山客的使用方式。万一遇难时，民间的救援费用将全部由登山客承担，非常昂贵。因此，建议事先投保保险。